Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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- i -

• id : pappso::cbor::mzcbor::Spectrum, pappso::cbor::psm::MzIdentMlReader::SpectrumIdentificationResult
• IdentificationEngine : pappso::cbor::psm::MzIdentMlReader
• includes() : pappso::GrpSubGroup
• incrementX() : pappso::DataPoint
• incrementY() : pappso::DataPoint
• index : pappso::cbor::mzcbor::Spectrum
• index_not_defined : pappso::spectree::SpecTree
• indexNodeMapSize() : pappso::MsRunDataSetTree
• indicativeBinSizeChanged() : pappso::MzIntegrationParams
• indice : pappso::specglob::ExperimentalSpectrumDataPoint
• informationsReady() : pappso::cbor::psm::PsmCbor2Json, pappso::cbor::psm::PsmFileAppend, pappso::cbor::psm::PsmFileReaderBase, pappso::cbor::psm::PsmFileScanProcessAndCopy
• initCborReader() : pappso::cbor::CborStreamReaderInterface
• initFastAlign() : pappso::specpeptidoms::SemiGlobalAlignment
• InitializationResult : pappso::MzIntegrationParams
• initialize() : pappso::BafAsciiFileReader, pappso::BafAsciiMsRunReader, pappso::BasePlotContext, pappso::DataPoint, pappso::LocalSignalToNoiseEstimator, pappso::MapTrace, pappso::MassSpecTracePlotContext, pappso::MsRunReader, pappso::MzcborMsFileReader, pappso::MzcborMsRunReader, pappso::MzIntegrationParams, pappso::PwizMsFileReader, pappso::PwizMsRunReader, pappso::SavGolParams, pappso::TimsMsFileReader, pappso::TimsMsRunReaderBase, pappso::TimsMsRunReaderDia, pappso::TimsMsRunReaderMs2, pappso::TimsMsRunReaderMs2Selected, pappso::Trace, pappso::XyMsFileReader, pappso::XyMsRunReader
• initializeAndClone() : pappso::XicCoord, pappso::XicCoordTims
• initpreciseAlign() : pappso::specpeptidoms::SemiGlobalAlignment
• insert() : pappso::cbor::psm::PsmProteinMap
• insertOrUpdate() : pappso::MapTrace
• insideElement() : pappso::cbor::mzcbor::MzmlConvert
• integrationRequestedSignal() : pappso::BasePlotWidget
• IntegrationScope() : pappso::IntegrationScope
• IntegrationScopeBase() : pappso::IntegrationScopeBase
• IntegrationScopeRect() : pappso::IntegrationScopeRect
• IntegrationScopeRhomb() : pappso::IntegrationScopeRhomb
• IntegrationScopeSpec() : pappso::IntegrationScopeSpec
• intensity : pappso::masschroq::Peptide::AlignedPeakPositionElement, pappso::masschroq::Peptide::MsRunXicCoordCharge, pappso::MsRunRetentionTimeSeamarkPoint< T >, pappso::PrecursorIonData
• intensity_index : pappso::TimsFrameBase::TofIndexIntensityPair
• IntensityThresholdCalculation : pappso::LocalSignalToNoiseEstimator
• INTRA_CLUSTER_INTER_PEAK_DISTANCE : pappso::FilterLowIntensitySignalRemoval
• Ion() : pappso::Ion
• ion_charge : pappso::SimplePeakIonMatch
• ion_mobility : pappso::cbor::psm::SageTsvHandler::Line
• ion_mz : pappso::SimplePeakIonMatch
• ion_size : pappso::SimplePeakIonMatch
• ion_type : pappso::SimplePeakIonMatch
• ionChanged() : pappso::MassSpectrumWidget
• ionDeltatMzMassMap : pappso::PeptideRawFragmentMasses
• IonIsotopeRatioScore() : pappso::IonIsotopeRatioScore
• ionizationMode : pappso::MassSpectrumLineData
• IonList : pappso::PeptideFragmentIonListBase
• IonMobilityGrid() : pappso::IonMobilityGrid
• ionSourceType : pappso::MassSpectrumLineData
• is1D() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::SelectionPolygon
• is2D() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::SelectionPolygon
• is_decoy : pappso::cbor::psm::MzIdentMlReader::MzidDBSequence
• isA() : pappso::OboPsiModTerm
• isAaEqual() : pappso::Aa
• isAligned() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
• isClickOntoXAxis() : pappso::BasePlotWidget
• isClickOntoYAxis() : pappso::BasePlotWidget
• isContaminant : pappso::cbor::psm::PsmProtein
• isDdaRun() : pappso::TimsData
• isDecoy : pappso::cbor::psm::MzIdentMlReader::MzidPeptideEvidence
• isDiaRun() : pappso::TimsData
• isEmpty() : pappso::PeptideNaturalIsotopeAverage
• isEmptyMassSpectrum() : pappso::QualifiedMassSpectrum
• isInt : pappso::cbor::mzcbor::BinaryDataArray
• isIntensity() : pappso::cbor::mzcbor::BinaryDataArray
• isInternal() : pappso::AaModification
• isLesser() : pappso::Aa
• isMonoThread() : pappso::MsRunReader
• isMz() : pappso::cbor::mzcbor::BinaryDataArray
• isMzcbor() : pappso::cbor::mzcbor::MzcborReaderBase
• isMzcborIndex() : pappso::cbor::mzcbor::MzcborIndexReader
• isMzInRange() : pappso::TimsDiaSlices::MsMsWindow
• isOboTerm() : pappso::OboTermForm
• isOboTermSelected() : pappso::OboChooserWidget
• isObservedInMsRunSp() : pappso::masschroq::Peptide
• IsolationMz : pappso::TimsDiaSlices::MsMsWindow
• isolationMz : pappso::TimsDdaPrecursors::SpectrumDescr
• IsolationWidth : pappso::TimsDiaSlices::MsMsWindow
• isolationWidth : pappso::TimsDdaPrecursors::SpectrumDescr
• isolationWindow : pappso::cbor::mzcbor::Precursor
• isotope : pappso::IsotopeCount
• isotope_error : pappso::cbor::psm::SageTsvHandler::Line
• isPalindrome() : pappso::Peptide, pappso::PeptideFragment, pappso::PeptideFragmentIon, pappso::PeptideInterface, pappso::PeptideNaturalIsotope
• isReadAhead() : pappso::masschroq::PrecursorParser, pappso::SpectrumCollectionHandlerInterface
• isRectangle() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::SelectionPolygon
• isRemoveZeroValDataPoints() : pappso::MzIntegrationParams
• isRhomboid() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb
• isSelectionRectangleVisible() : pappso::BasePlotWidget
• isSpectrumIndex : pappso::cbor::psm::MzIdentMlReader::SpectrumIdentificationResult
• isTarget : pappso::cbor::psm::PsmProtein
• isUnimod() : pappso::OboPsiModTerm
• isValid() : pappso::DataPoint, pappso::MassSpectrumId, pappso::MsRunId, pappso::MzIntegrationParams, pappso::OboPsiModTerm
• isVerticalDisplacementAboveThreshold() : pappso::BasePlotWidget
• it_experimental_peak_match : pappso::specglob::TheoreticalPeakDataPoint
• ItemCart() : pappso::spectree::ItemCart
• Iterator : pappso::MassDataCombinerInterface
• ivector() : pappso::FilterSavitzkyGolay